一、检查气体过滤器、载气、进样垫和衬管等
检查进样垫和气体过滤器，保证辅助气和检测器用气通畅有效。如果以前做过沸点较高的化合物，需要将进样口衬管清洗或更换。
二、将螺母和密封垫圈装在柱上，并将色谱柱两端口小心切平
在色谱柱的一端装上相应的螺母和密封垫圈，此时色谱柱端口无前后之分，色谱柱支架的支撑部分应总是朝向着柱箱门。安装好螺母和密封垫圈后，用陶瓷刀片将色谱柱端口切平，并用放大镜进行检查，以确认切口和管壁成直角，并且没有残留的碎屑、没有毛边或不平的切割面。
三、将色谱柱连于进样口上
通常来说，色谱柱的顶端应保持在进样口衬管的中下部，当进样针穿过隔垫插人进样口后，如果针尖与衬管中的色谱柱顶端相差1-2cm，这就是较为理想的状态。从色谱柱架上取出需要连接的足够的长度，并按步骤2切割柱子，连接到进样口。避免用力弯曲压挤色谱柱，并小心不要让标记牌等有锋利边缘的物品与色谱柱接触磨擦，以防柱身断裂或受损。将色谱柱正确地嵌人进样口后，把连接螺母拧上，用手拧紧后用扳手再拧1/4一1/2圈。
将色谱柱悬挂在色谱仪器炉箱内，注意不要刮伤色谱柱外表面涂层，色谱柱不能与炉箱表面接触。
四、接通载气
载气须为高纯氮气（或氦气），纯度达99．999％，使用极性柱时（如FFAP、PEG-20M等），载气加脱氧管进一步脱氧，这样可延长柱子的使用寿命。
当色谱柱与进样口连接好后，接通载气。调节柱前压力以得到合适的载气流速。将色谱柱的另一端（空端），插人装有乙醇的样品瓶中，正常情况下，我们可以看见瓶中稳定持续的气泡。如果没有气泡，就要重新检查一下载气装置和
流量控制器等是否全部安装或设置正确，并检测一下整个气路有无泄漏。等所有问题解决后，将色谱柱端口从瓶中取出，擦试干净，保证柱端口无溶剂残留，再进行下一步安装。
毛细管柱前压参考设置(Mpa)
| 柱长（m） | 柱内径（mm） | 0.25 | 0.32 | 0.53 |
| 15 | 柱前压（Mpa） | 0.05 | 0.04 | 0.02 |
| 30 | 0.1 | 0.08 | 0.03 | |
| 50 | 0.18 | 0.14 | 0.05 |
五、将色谱柱连于检测器上
其安装和所需注意的事项与以上色谱柱与进样口连接（步骤三）部分所讲述的大致相同。安装时要注意色谱柱末端要高于尾吹点，或按照色谱仪说明书安装。
六、进行气体检漏
在色谱柱加热前，要对GC系统进行检漏。建议使用1：1的异丙醇：水的混合溶液进行检查。
七、色谱柱的老化
色谱柱安装和系统检漏工作完成后，就可以对色谱柱进行老化了。将色谱柱程序升温至最高使用温度的30℃以下，恒温30分钟。这样柱子内吸附的组份会被吹出，以免影响您的分析。
最后，将色谱柱的温度降低至所需要的温度，即可进行实际样品的分析。
八、色谱柱的正确使用
毛细管色谱柱的寿命与所使用的载气纯度、水蒸气含量以及分析样品的性质有关，操作不当将导致色谱柱寿命降低，延长其寿命的办法是合理科学的使用。
1、为延长色谱柱使用寿命，在不分析样品时，将色谱柱柱温降低至100℃以下。
2、每一根色谱柱都具有上限和下限使用温度。通常，最低使用温度是固定相的相变温度，当操作温度低于下限温度时，色谱峰形变坏、分离度下降，但不会损坏色谱柱。上限温度通常有两个，较低的是恒温上限温度，较高的是程序升温上限温度。色谱柱保持在上限温度的时间应小于10min
九、色谱柱的保存
在不使用时，用配置的堵头或进样隔垫密封色谱柱两端，避免水分和化学挥发物的污染，并存放在原包装盒内。再次使用时，用陶瓷刀片切除色谱柱两端，以防止堵头碎片堵塞色谱柱。
